分子建模软件Discovery Studio 3.0.0 X86破解版
Discovery Studio 3.0.0 X86
价      格:¥ 30.00
30天售出:28
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商品详情

 iscovery Studio是BIOVIA针对生命科学的综合预测科学应用程序,是一套基于BlovIA Pipeline Pilot的全面验证科学应用程序。该软件提供了独特的开放式,可扩展的协作研究工具,旨在满足当今生命科学发现研究的需求。是BIOVIA在生命科学领域的预测科学和建模与仿真的主要版本。使用Discovery Studio,旨在帮助用户在计划实施之前,先在计算机中进行详细的调查和测试假设,以避免出现错误,而增加资源和精力的浪费,并减少将产品推向市场所涉及的时间和费用,软件通过大量值得信赖的生命科学建模和仿真工具,推动从目标识别到领先优化的科学探索,利用开放且可扩展的平台来自动化流程,创建和部署自定义工作流,以及集成数据类型,数据库和第三方或内部工具,通过使研究人员能够共享数据并做出更明智的决策,提高个人生产力并促进团队协作,BIOVIA Discovery Studio包含高度通用的CHARMm分子力学模拟程序。 凭借30多年的同行评审学术研究,CHARMm的开发主要集中在研究蛋白质,多肽,小分子配体,核酸,脂类和碳水化合物。对于基于量子力学的研究,BIOVIA Discovery Studio包含DMol3程序。 DMol3是一个DFT计划,拥有成功商业应用的长期记录。 凭借其解决量子力学方程的独特方法,DMol3长期以来一直是可用于执行计算的最快方法之一,这一优势尤其适用于具有500多个原子的大型系统。本次小编带来的是BIOVIA Discovery Studio3.0最新破解版,含许可证文件和安装破解激活图文教程!
分子建模软件Discovery Studio

安装破解教程

1、在本站下载并解压,得到PP80_with_CU2_Win32 DS3.0安装文件夹和Lisences许可证文件夹

2、在安装文件夹中找到scitegicsetup.exe双击运行安装,如图所示,点击next
3、点击accept
4、如图所示,点击浏览选择许可证文件夹中的7_0_license-VarianteA.lic,首先使用7_0 license-VariantA.lic安装PP8.0
5、然后使用DSCollection.lic安装DS3.0

6、安装完成后,启动DS3.0,使用boostrys_25.lic激活即可

软件功能

使用CHARMm c41b1进行分子力学(MM)计算
支持广泛的功率场,包括CGenFF,charmm36,charmm27,charmm22,CHARMm,CHARMm-polarH,CFF,MMFF等等。
完全支持CHARMM分区机制并支持自定义无效定义
使用天生的CHARMm溶剂模型(GB),快速准确地电离蛋白质和残余pKs。
饮用水的快速溶剂,可选抗离子,适用于非常大的分子体系
根据GB标准进行任何溶剂显式或最小化溶剂型分子力学(MM)
基于溶剂进行明确的溶剂或分子动力学模拟
为蛋白质结构添加一个隐含膜,以便您可以基于场强制定模拟模型。
使用基于CHARMm的对接引擎CDOCKER来执行基于配体的配体结合和精炼对接。

1、综合科学组合
·科学解决方案满足从早期发现到临床前和生物治疗配方开发的研究需求
2、成熟的科学
·支持Discovery Studio的核心科学得到了长达30年的同行评审研究的支持
3、协作研究
·借助DS Visualizer,Discovery Studio提供了真正免费的可视化和协作框架
4、Discovery Studio:基于管道导频的本机应用程序
·每个Discovery Studio任务都是一个Pipeline Pilot协议,可确保真正开放的建模和仿真环境
·可定制的,可扩展的科学
·可扩展的架构
·可部署的工作流程
·实现科学创新
·与第三方应用程序开箱即用,包括CCDC GOLD *和Urbana-Champaiqn NAMD +的伊利诺伊大学
·Discovery Studio子许可下列Pipeline Pilot组件集合:核心,集成,报告,化学,序列分析,ADMET
5、全面的预测科学套件
·模拟:
·基于BlOVIA CHARMm的一流模拟“力场引擎,包括单点,最小化,分子动力学模拟和自由能计算
·使用DMol3完全从头开始基于DFT的Ouantum Mechanics半经验(VAMP)和混合QM / MM(DMol5 /CHARMM)
·高分子设计与分析:
·市场领先的MODELER同源建模算法
·一流的基于pH的蛋白质电离工具
·独特的基于pH的蛋白质稳定性和结合亲和力
6、突变分析
·使用ZDOCK抗体开发可靠的蛋白质 - 蛋白质结合预测
·第一套也是最完整的结构预测和模拟工具,专门用于抗体研究
·经过验证的自动化结构预测工作流程,旨在提供最佳的抗体同源模型
·独特的专利AggMap蛋白聚集和可开发性指数
·快速鉴定与生物治疗药物中的翻译后修饰(PTM)位点相关的序列基序基于结构的设计(SBD)
·基于物理的新型(CHARMm CDOCKER)对接引擎
·独特的非结合分析监测器,包括有利,不利和不满足的交互类型
·新型基于MMP的活动悬崖基于碎片的设计(FBD)
·使用来自BlOVIA ACD的ca.10k预过滤试剂,使用经典的药物化学反应进行原位计数
·使用来自BIOVIA SCD的约1.5M市售化合物原位进行支架跳跃
·新型Karplus MCSS(多重复制同时搜索)
·基于片段的设计(FBD)
·使用来自BlOVIA的ca.10k预过滤试剂,使用经典的药物化学反应来原位计数
7、基于片段的设计(FBD
·使用来自BlOVIA ACD的ca.10k预过滤试剂,使用经典的药物化学反应进行原位计数
·使用来自BIOVIA SCD的约1.5M市售化合物原位进行支架跳跃
·新型Karplus MCSS(多重复制同时搜索)
细分对接引擎
8、药效团和基于配体的设计:
·市场领先的CATALYST药效团引擎
·包括独特的受体 - 配体药效团创建
·最大的验证配体分析数据库,PharmaDB
9、QSAR,ADMET和TOPKAT预测毒理学
·QSAR:计算物理化学,拓扑指纹特性并创建PLS,GFA,MLR等
·最广泛的ADMET和预测毒理学模型,包括BBB渗透,肝毒性,CYP2D6,AMES,大鼠口腔LD50和更多的
10、X射线
·使用CNX,生成电子密度图,进行全面细化,并使用HT-X PIPE进行蛋白质 - 配体复合物的自动结构测定

软件优势

1、小分子亲和力建模  
使用新的自由能扰动(FEP)方法准确预测同类配体系列的相对配体结合能  
2、药效植物筛选:  
KeyCatalyst®药效团协议经过重新设计,可提高并行计算的性能和可扩展性  
3、Rational抗体设计  
预测稳定人源化残基突变:预测突变以使抗体更兼容,而不会影响抗体稳定性  
4、力场  
实施了Brooks实验室的MATCH原子打字引擎,增强了CGenFF打字支持(DOI:10.1002/jcc.21963)  
添加了CHARMMPBEQPoisson-Boltzmann静电解算器,用于增强静电势的表示  
支持CHARMMc42b1  
5、毒性  
所有TopKat模型现已作为欧洲委员会联合研究中心(JRC)的QMRF报告发布

使用说明

DiscoveryStudio包含以下工具:  
1、使用CHARMmc42b1进行分子力学(MM)计算  
2、支持广泛的力场,包括CGenFF,charmm36,charmm27,charmm22,CHARMm,CHARMm-polarH,CFF,MMFF等  
3、完全支持CHARMM修补机制和自定义不正确的定义支持  
4、使用CHARMmGeneralized-Born(GB)溶剂模型快速准确地进行蛋白质电离和残留pKs  
5、快速显式水溶剂化方法,具有适用于非常大的分子系统的任选抗衡离子  
6、执行明确的溶剂或隐含的基于GB溶剂的分子力学(MM)最小化  
7、执行显式溶剂或基于溶剂的隐式分子动力学(MD)模拟  
8、在蛋白质结构中添加隐性膜,以帮助在基于力场的模拟过程中改进模型  
9、或者,启动NAMD计算并执行MD模拟  
10、在具有静态或柔性受体的受体的背景下进行多个配体的姿势优化  
11、使用基于CHARMm的对接引擎CDOCKER执行灵活的基于配体的对接和对接改进  
12、使用显性溶剂原位MM-PBSA或基于MM-GBSACHARMm的方法评分结合相互作用  
13、使用新的自由能扰动(FEP)方法准确预测同类配体系列的相对配体结合能  
14、使用基于CHARMm的转向分子动力学(SMD)模拟估计配体结合自由能并研究配体解除结合  
15、使用混合量子力学(QM)/MM模拟计算单点能量或执行受体-配体复合物的最小化  
高分子设计与分析:
确定大分子的三维结构和性质,如酶,抗体,DNA或RNA,是广泛研究活动的基本组成部分。DiscoveryStudio提供全面的市场领先,经过验证的科学工具组合,能够协助基于大分子的研究的各个方面。  
使用DiscoveryStudio,您可以快速轻松地:  
1、执行多序列比对(BLAST和PSI-BLAST)  
对于抗体和多链蛋白,同时且独立地进行每个蛋白质链的多个序列比对  
2、使用MODELER生成3D结构模型  
从3D结构存储库(例如,PDB)分析和清理模型  
从序列信息或X射线衍射数据直接构建同源模型  
使用LOOPER系统地搜索循环构造并使用CHARMm排名  
或者,从模板结构到目标模型的移植物环构象  
使用ChiRotorCHARMm模拟系统地优化氨基酸侧链  
预测跨膜蛋白序列中的跨膜螺旋  
验证结构模型的质量  
3、研究与其合作伙伴的大分子相互作用  
使用ZDOCK进行蛋白质-蛋白质对接并预测蛋白质结合配偶体  
4、使用CHARMmc41b1进行基于力场的模拟  
预测蛋白质的等电点和pH依赖性稳定性  
预测在指定pH下的蛋白质电离和质子化残留物  
使用显式溶剂化模型进行大分子模拟  
使用隐式溶剂化或隐式膜模型进行大分子模拟  
5、预测氨基酸突变对大分子特性的影响  
对结合亲和力的影响  
基于温度或pH的稳定性  
蛋白质聚集和可开发性  
确定稳定的二硫桥位点  
6、使用基于CHARMm的转向分子动力学(SMD)模拟研究蛋白质去折叠或构象变化  
7、使用基于序列的motif搜索预测易于翻译后修饰(PTM)的站点  
8、通过预测二硫键位点来提高蛋白质的稳定性  
免责申明:
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